Los cuidados inadecuados de los bonsái pueden ocasionar que se debiliten y queden expuestas al ataque de enfermedades y plagas. La poda defectuosa perjudica al árbol permitiendo la aparición de hongos, podredumbre, y otras enfermedades. El control periódico ayuda a prevenir el ataque de plagas, y a curar enfermedades en etapas tempranas.